研究背景:
细胞外囊泡(EVs)是细胞分泌的脂质双层膜囊泡,直径30–1000 nm,在细胞间通讯中发挥关键作用,其内含RNA、DNA、脂质和蛋白质等生物活性分子,被视为癌症、神经退行性疾病等多种疾病的生物标志物载体,同时在药物递送、再生医学及化妆品领域展现出巨大应用潜力。然而,传统EV分离方法(如超速离心、密度梯度离心、尺寸排阻色谱等)普遍存在设备昂贵、操作繁琐、通量受限、需复杂预处理(如连续离心和微滤)等瓶颈,严重制约了EV从基础研究向临床及工业化应用的转化。因此,开发一种兼具高效性、可扩展性、易获取性和可定制性的EV分离技术,已成为该领域亟待突破的核心科学问题。

针对上述问题,韩国科学技术院脑科学研究所Nakwon Choi、Ji Yoon Kang和高丽大学Ki Wan Bong合作,提出了一种基于介孔-大孔水凝胶的直接细胞外囊泡分离技术,无需预处理即可从多种生物体液(如全血、唾液、尿液、牛奶等)中高效分离细胞外囊泡,并支持升规模操作。该水凝胶具有约400纳米的孔径,通过表面电荷选择性捕获囊泡,并利用高离子强度实现高效回收,同时还可作为固相载体长期保存细胞外囊泡,便于后续分析。该文章于2025年9月24日以《Meso–macroporous hydrogel for direct litre-scale isolation of extracellular vesicles》为题发表于《Nature Nanotechnology》(DOI: 10.1038/s41565-025-02011-1)。

(1)介孔-大孔水凝胶的制备与EV捕获原理
研究团队以700 Da分子量PEG二丙烯酸酯(PEG700DA)为前驱体,经-80 °C预冻10 min、365 nm紫外(2.5 mW·cm⁻²)曝光2 min的冷冻光交联制备介孔-大孔水凝胶颗粒,PDMS模具可实现121颗/批次的规模化生产(图1c,d)。荧光扩散实验证实该凝胶允许≤200 nm颗粒自由渗透而阻挡450 nm颗粒,未经预冻的微孔凝胶则连4.72 nm指示剂亦无法透过。EV分离采用"凝胶内捕获→洗涤→凝胶外回收"三步法,无需预处理及特殊设备(图2a),SEM/TEM/CLEM证实EV经1.5 M NaCl高盐环境选择性富集于凝胶内部,去盐后成功回收,产率较微孔凝胶提升约28倍(图2b)。其机制为PEG三维网链在高离子强度下通过空间屏蔽与Na⁺介导的静电排斥减弱,诱导EV表面电荷选择性聚集;而VLDL、LDL等胆固醇杂质因表面电荷差异几乎不被捕获(图2c)。Western blot证实CNX、APOB、APOA1、GOLGA2、CSN1S1等非EV杂质未检出或显著降低,冷冻电镜显示回收颗粒具典型脂质双层结构,负染TEM证实分离产物几乎无脂蛋白、病毒等污染物(图2d)。

图2.介孔-大孔水凝胶直接EV分离的流程与基本原理。a)EV分离流程示意图,包括一体式管分离(粉色虚线框)或可换管分离(绿色虚线框),标签1、2、3代表各步骤中样品依次转移至新管,SEM图像分别显示EV分离前(i)、凝胶内捕获后(ii)及凝胶外回收后(iii)的颗粒截面;b)介孔-大孔(蓝色)与微孔(灰色)水凝胶颗粒的EV产率及蛋白浓度(产率技术重复n=5,蛋白浓度n=3);c)介孔-大孔水凝胶与盐(NaCl)介导的凝胶内主动捕获EV原理示意图,虚线框i–iii展示捕获机制的动态过程;d)介孔-大孔水凝胶分离EV的冷冻透射电镜图像,显示脂质双层结构。
(2)升规模EV分离与批次可重复性
通过按比例增加水凝胶颗粒数量,研究团队成功从1 L胃癌患者腹水及1 L牛乳中直接分离EV。五例晚期胃癌患者腹水EV均显示典型EV尺寸分布、产率及纯度,且均表达EV阳性标志物CD63、PDCD6IP(ALIX)及肿瘤转移标志物N-cadherin(CDH2)、claudin-1(CLDN1)、angiogenin(ANG)(图3a,b)。1 L牛乳EV分离量较1 mL提升三个数量级,且尺寸分布、产率及纯度与1 mL批次无显著差异(图3c–e),表明该方法在升级别仍保持一致性。此外,水凝胶颗粒经RIPA处理后重复使用,EV产率与新鲜颗粒无统计学差异,展现出良好的可持续性与成本效益。

图3.介孔-大孔水凝胶颗粒的升级别直接EV分离。a)五例胃癌患者腹水EV的尺寸分布、产率及纯度(技术重复n=5,生物学重复n=5);b)Western blot显示腹水EV中EV阳性标志物(CD63、PDCD6IP)及肿瘤转移标志物(CDH2、CLDN1、ANG)的表达(每泳道上样总蛋白70 μg);c)玻璃瓶中冻干水凝胶颗粒(左)及倒入1 L牛乳后的照片(右);d)1 L(紫色)与1 mL(蓝色)牛乳EV分离量(技术重复n=3);e)1 L与1 mL牛乳EV的尺寸分布、产率及纯度(产率P=0.1119,纯度P=0.3422,无显著差异)。
(3)水凝胶作为EV固相保存载体
与常规大孔水凝胶脱水后机械强度不可逆丧失不同,介孔-大孔水凝胶经冻干-再水化循环后仍保持结构完整性(图4a)。加速老化实验(94 °C、3天,等效24 °C储存1年)及冻干再水化后,血浆EV产率与新鲜湿态颗粒无显著差异(P=0.8578),证实其卓越的长期稳定性(图4b)。
将EV捕获并洗涤后的水凝胶颗粒冻干,室温储存数天后回收,EV的尺寸分布、产率及纯度与立即回收组无显著差异(P=0.4445);室温储存60天内,产率在32天内保持相对稳定,至第60天仅下降约20%,显著优于文献报道的-20 °C储存8周产率下降约80%及-80 °C下降约40%的结果(图4c–e)。该特性使水凝胶成为无需冷链的EV固相保存载体,极大拓展了EV的时空应用范围。

图4.介孔-大孔水凝胶作为EV保存载体。a)水凝胶颗粒湿态(左)、冻干脱水态(中)及再水化态(右)的照片,白色虚线圆圈指示冻干前湿态颗粒尺寸;b)加速老化1年等效(红色)、冻干再水化(黄色)及湿态(蓝色)颗粒分离EV的产率(P=0.8578,无显著差异);c)从冻干EV捕获水凝胶颗粒室温储存后分离EV的流程示意图;d)立即回收(对照,蓝色)与冻干EV捕获水凝胶颗粒室温储存5天后回收(红色)的EV尺寸分布及纯度(P=0.4445);e)冻干后不同储存时间EV的相对产率(以第0天产率为基准,技术重复n=3)。
(4)可定制性与多生物流体适用性
通过调节凝胶外回收体积,可在保持相同EV总量的前提下实现按需富集(图5a)。制备更小体积(10 μL/颗)的水凝胶颗粒,可将回收体积降至10 μL而不损失EV,且将分离时间从80 min缩短至15 min(图5b,c)。通过调控冷冻温度(-80 °C vs -195 °C液氮),可调节冰晶尺寸进而调控孔径,实现较小EV亚群的选择性分离,产率略降但纯度保持(图5d,e)。
该方法适用于全血、血浆、腹水、唾液、尿液、牛乳及干细胞培养基等多种生物流体。尤其值得注意的是,传统方法需经连续离心和过滤去除红细胞、白细胞及血小板后才能从全血中分离EV,而本方法可直接处理全血,人全血EV产率约为超速离心的2倍,纯度相当(图5f,g);小鼠全血中产率高3倍、纯度高1.2倍。对于唾液和hESC培养基等EV浓度低、黏度高的样本,该方法同样展现出与超速离心相当或更优的产率与纯度,且可获得更高比例的小EV(30–200 nm)。

图5.水凝胶基EV分离的可定制性与多用途性。a)不同凝胶外回收体积下的EV产率(蓝色)与总量(灰色)(与200 μL相比,40 μL和400 μL产率P=0.0002和P<0.0001,总量无显著差异);b)10 μL颗粒在不同回收体积下的EV总量(P=0.1779);c)15 min与80 min分离时间的EV尺寸分布、产率及纯度(产率P=0.0894,纯度P=0.0403);d)不同冷冻温度(-80 °C vs -195 °C)下制备水凝胶分离EV的粒径(P=0.0011);e)不同冷冻温度下EV的尺寸分布、产率(P=0.0204)及纯度(P=0.8866);f)人全血EV分离流程对比示意图(水凝胶法80 min vs 超速离心185 min);g)水凝胶(蓝色)与超速离心(灰色)分离全血EV的尺寸分布、产率(P=0.0035)及纯度(P=0.7986)。
(5)下游治疗与诊断应用
在治疗与化妆品领域,牛乳EV因其治疗潜力备受关注,但传统超速离心需7步连续离心/过滤、耗时超6 h。水凝胶法不仅省去繁琐预处理,分离时间缩短约5.6倍,且产率和纯度显著优于超速离心,同体积牛乳可获得1539倍更多的纳米颗粒(图6a,b)。等体积分析(1 mL分离产物处理50 mL来源乳)显示,水凝胶分离的牛乳EV使人真皮成纤维细胞(hDFs)增殖提升22%(较超速离心)和50%(较对照);等蛋白量分析中,两组对hDFs增殖及II型胶原表达的促进作用相当。人角质形成细胞(HaCaT)实验证实,水凝胶分离的牛乳EV可促进细胞增殖并提升谷胱甘肽化蛋白表达,与超速离心组效果相似,且该效应确源于EV本身而非残留蛋白(图6c–g)。
在诊断领域,研究团队从人尿液中直接分离EV,通过水凝胶基杂交链式反应(HCR)检测EV miRNA(miR-6090/miR-3665),成功实现前列腺癌患者与健康对照的显著区分(P<0.0001)(图6h,i),验证了该方法在临床诊断中的实用性。

本研究开发的介孔-大孔PEGDA水凝胶颗粒通过冷冻光交联构建约400 nm孔道,仅添加NaCl即可实现多种生物流体(全血、血浆、腹水、唾液、尿液、牛乳、细胞培养基)中EV的直接、高效、可扩展分离,无需任何预处理。其核心优势包括:①产率较微孔水凝胶提升28倍,与超速离心等传统方法相当或更优;②可扩展至升级别分离(1 L腹水/牛乳),且批次间、操作者间可重复性优异;③作为固相载体,冻干后室温储存60天产率仅下降约20%,无需冷链;④通过调节回收体积、颗粒尺寸、冷冻温度实现按需富集、快速分离及亚群分选;⑤直接处理全血,绕过传统方法必需的细胞去除步骤;⑥分离的EV在细胞治疗、化妆品及癌症诊断中均展现良好功能。该平台的工业转化需解决大规模制备的自动化及连续流工艺(如填充床反应器)等挑战,但其为EV的基础研究、临床转化及产业化提供了极具影响力的技术框架。
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